Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bp5Q9Z131 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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