Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms