Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F6

Rad9a, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad9aQ9Z0F6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad9aQ9Z0F6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad9aQ9Z0F6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms