Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Pacsin2Q9WVE8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms