Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nme4Q9WV84 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme4Q9WV84 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms