Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms