Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms