Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pus1Q9WU56 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms