Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MthfrQ9WU20 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms