Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms