Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam50bQ9WTJ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms