Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms