Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms