Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms