Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf346Q9R0B7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf346Q9R0B7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms