Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nek3Q9R0A5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms