Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms