Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abt1Q9QYL7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abt1Q9QYL7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abt1Q9QYL7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms