Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcb11Q9QY30 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcb11Q9QY30 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcb11Q9QY30 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcb11Q9QY30 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcb11Q9QY30 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcb11Q9QY30 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms