Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354bQ9QXT9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms