Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Limd1Q9QXD8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms