Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phc2Q9QWH1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phc2Q9QWH1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms