Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid2Q9QUS6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid2Q9QUS6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms