Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl2Q9QUK0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms