Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkain4Q9JMG4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms