Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cabp1Q9JLK7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms