Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms