Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms