Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms