Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ybx3Q9JKB3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms