Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms