Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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