Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfhx4Q9JJN2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms