Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad9Q9JIW5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms