Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbr1Q9JIT0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms