Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc12a4Q9JIS8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc12a4Q9JIS8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms