Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp1r3fQ9JIG4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms