Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Exosc9Q9JHI7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exosc9Q9JHI7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms