Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES82

Popdc2, Popeye domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc2Q9ES82 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Popdc2Q9ES82 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc2Q9ES82 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms