Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ush1cQ9ES64 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms