Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf3Q9ES30 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf3Q9ES30 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms