Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms