Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfip11Q9ERA6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms