Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms