Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf1Q9EPU0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf1Q9EPU0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf1Q9EPU0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms