Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms