Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xab2Q9DCD2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms