Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde1Q9DBZ9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms