Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms