Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim23Q9DAL0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim23Q9DAL0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim23Q9DAL0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim23Q9DAL0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim23Q9DAL0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim23Q9DAL0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim23Q9DAL0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.8 ms